Согласно Постановлению администрации Алтайского края от 17.10.2003 № 529, одно из направлений по улучшению экологической обстановки и охране природной среды региона – это создание научно-обоснованной системы особо охраняемых природных территории (СООПТ). Работа в данном направлении активно проводится сотрудниками ИВЭП СО РАН. Например, Ротановой И.Н. и Андреевой И.В. был разработан проект системы ООПТ Алтайского края. Эти авторы предлагают организовать на территории края три новых заповедника: Благовещенский, Салаирский и Волчихинский. В 2012 -2013 гг. проект СООПТ Алтайского края был пересмотрен. В августе 2013 г. утверждена «Схема развития и размещения особо охраняемых природных территорий Алтайского края на период до 2025 года», где, например, предлагается создать, такие новые ООПТ как: природный парк «Кулундинский» и национальный парк «Тогул» («Салаирский»).
При планировании территории с охранными целями необходима типизация природных комплексов, а также анализ современного состояния и использования отводимой территории. Для этого эффективным является использование кадастровых данных и космических изображений. Такой работы для указанных проектируемых ООПТ в крае пока не проводилось.